对于漳州公司来说，福州作为一个重要的经济中心，商标注册申请是保护品牌和市场权益的重要步骤。然而，商标注册涉及的法律和程序复杂，许多公司选择寻求专业代理公司的帮助。那么，漳州公司在福州商标注册申请时如何选择专业代理公司呢？

一、了解代理公司的资质和信誉

首先，漳州公司应该核实代理公司的资质和信誉。确保代理公司具有合法的营业执照和商标代理资质，并在业界有良好的口碑和声誉。可以通过查询相关机构或参考其他客户的评价来了解代理公司的实力和信誉。

二、考察代理公司的专业能力和经验

其次，漳州公司应该考察代理公司的专业能力和经验。了解代理公司是否拥有专业的商标律师团队，以及他们在商标注册领域的经验和成功案例。一个有丰富经验和专业能力的代理公司能够为客户提供更加全面和专业的服务。

三、比较代理公司的服务内容和费用

漳州公司还可以比较不同代理公司的服务内容和费用。了解代理公司提供的具体服务内容，如商标注册咨询、申请准备、审查跟进等，并根据公司的实际需求选择适合的服务。同时，比较不同代理公司的收费标准，选择性价比较高的代理公司。

四、与代理公司沟通并建立良好的合作关系

最后，漳州公司应与代理公司建立良好的沟通和合作关系。与代理公司保持及时沟通，明确需求和期望，并确保代理公司能够理解并满足公司的需求。同时，建立长期的合作关系可以确保商标注册过程的顺利进行，并及时解决可能出现的问题。

综上所述，漳州公司在福州商标注册申请时选择专业代理公司时，应关注代理公司的资质、信誉、专业能力和经验，比较服务内容和费用，并与代理公司建立良好的合作关系。这将有助于漳州公司顺利完成商标注册申请，保护品牌和市场权益。